Заклад вищої освіти "Подільський державний університет" - це сукупність структурних підрозділів, які й складають матеріально-технічну базу вищого навчального закладу та дають можливість студентам отримувати теоретичні та практичні навики.
Університет об’єднує чотири факультети та три навчально-наукові інститути, які пропонують різнопрофільну освіту:
- Факультет агротехнологій і природокористування.
- Інженерно-технічний факультет.
- Факультет ветеринарної медицини і технологій у тваринництві.
- Факультет енергетики та інформаційних технологій.
- Навчально-науковий інститут бізнесу і фінансів.
- Навчально-науковий інститут заочної і дистанційної освіти.
- Навчально-дослідний інститут круп'яних культур ім. О. Алексеєвої.
Подільському державному університету підпорядковується ряд стукрутрних підрозділів:
- Відокремлені структурні підрозділи: Кам’янець-Подільський фаховий коледж ЗВО "ПДУ"; Новоушицький фаховий коледж ЗВО "ПДУ"; Шепетівський фаховий коледж ЗВО "ПДУ"; Кіцманський фаховий коледж ЗВО "ПДУ"; Хотинський фаховий коледж ЗВО "ПДУ"; Снятинський фаховий коледж ЗВО "ПДУ"; Бучацький фаховий коледж ЗВО "ПДУ".
- Навчально-науковий центр перепідготовки і підвищення кваліфікації.
- Науково-дослідний центр "Поділля".
- Навчальна лабораторія "Ботанічний сад".
- Наукова бібліотека.
Навчання в ПДУ – міцний фундамент та впевнена перспектива для вдалого майбутнього.